《口袋怪獸綠寶石》是由網(wǎng)友制作的一款口袋妖怪同人改版游戲，在游戲中，玩家操作一位神奇寶貝訓(xùn)練家游歷豐緣地方、戰(zhàn)勝八位道館訓(xùn)練家并挑戰(zhàn)四天王及冠軍。主角借助神奇寶貝球收服神奇寶貝，并用收服的神奇寶貝與他人對戰(zhàn)。

《口袋妖怪 綠寶石》的故事設(shè)定在與前作的關(guān)都地方和城都地方有一定距離的豐緣地方。豐緣地方的設(shè)計基于日本的九州島和九州地方；然而豐緣相比其原型旋轉(zhuǎn)了90°，因為增田順一感到此舉會帶來更好的游戲平衡。像九州一樣，豐緣地方擁有許多小島，地區(qū)的一部分被海路充斥，玩家在其中的一部分海路中可以潛水。増?zhí)镯樢宦暶鞯孛麃碜詽h字“豊縁”，意為豐緣地方是個有“豐富緣分”的場所，表示人與神奇寶貝關(guān)系的主題。

1、祐樹（ユウキ）和小遙（ハルカ）

主角搬家來到豐緣地方的未白鎮(zhèn)，被小田卷博士贈予神奇寶貝圖鑒，踏上了冒險之旅。

2、火巖隊（マグマ団）和水艦隊（アクア団）

在紅藍(lán)寶石版中火巖隊和水艦隊會根據(jù)玩家選擇的版本出現(xiàn)一個。在綠寶石版中，火巖隊和水艦隊將會同時登場。主角將要阻止他們的陰謀。

3、亞希達(dá)（エニシダ）

脖子上懸掛著神奇寶貝領(lǐng)航員，戴著墨鏡的神秘男人。在綠寶石版中首次登場的他名為“金雀兒”。冒險中，主角在各種各樣的地方同他邂逅。是對戰(zhàn)開拓區(qū)的老板，只允許自己認(rèn)可的訓(xùn)練家進(jìn)入設(shè)施。

游戲的主角是一個剛剛搬家到未白鎮(zhèn)的孩子。在游戲之初，主角可以自小田卷博士處選擇木守宮、火稚雞和水躍魚中的一只作為自己的初學(xué)者神奇寶貝。主角的朋友兼勁敵也是一位神奇寶貝訓(xùn)練家，不時會挑戰(zhàn)主角。游戲的兩個主要目標(biāo)是戰(zhàn)勝道館訓(xùn)練家最終成為聯(lián)盟冠軍和通過收服進(jìn)化交換神奇寶貝來完成神奇寶貝圖鑒。

在旅途中他們遭遇了火巖隊和水艦隊，前者想要借助固拉多擴(kuò)張陸地，后者企圖操縱蓋歐卡擴(kuò)張海洋。在兩者召喚出各自的超古代神奇寶貝后，固拉多和蓋歐卡并未服從命令，開始大戰(zhàn)，將世界置于水火之中。主角喚醒了傳說中的神奇寶貝烈空坐，后者平息了固拉多和蓋歐卡的憤怒。主角在進(jìn)入殿堂后可以邂逅全豐緣地方四處游走的拉帝亞斯和拉帝歐斯，并訪問大挑戰(zhàn)地區(qū)。